Hensikten med manipulasjon er å normalisere funksjonen i rygg, bekken eller ekstremitetsledd hos en pasient. For å utføre manipulasjonen tar naprapaten grep med hendene over leddet. For å unngå å påvirke andre ledd enn det som skal manipuleres blokkerer naprapaten ikke ønskede bevegelser med hendene, og stiller inn ryggvirvlene rundt det aktuelle leddet. Naprapaten kan med dette være veldig spesifikk og unngå store bevegelsesutslag.

Naprapatens håndbevegelser avsluttes med et raskt trykk, en impuls / trust, som går ut over grensen for leddets fysiologiske bevegelighet, men dog uten å overskride den ytre anatomiske grensen. Impulsen / trusten utføres med maksimal hastighet, minimalt bevegelsesutslag og med middels til minimal kraft.